More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1651 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1651  pseudouridine synthase  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.561342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1435  RNA pseudouridine synthase family protein  57.2 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.540473  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  55.08 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0447  pseudouridine synthase  52.92 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1042  pseudouridine synthase  53.75 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0704  pseudouridine synthase  52.5 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0998  putative ribosomal large subunit pseudouridine synthase  48.31 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1298  RNA pseudouridine synthase family protein  46.86 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0731  RNA pseudouridine synthase family protein  47.06 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0808  RNA pseudouridylate synthase family protein  47.06 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  31.82 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  31.82 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  33.87 
 
 		 299 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  29.45 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  29.45 
 
 		 301 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  33.78 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0195  pseudouridine synthase, RluD  29.45 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0653986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2003  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.74 
 
 		 334 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.704766  normal  0.26865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0988  pseudouridine synthase  35.19 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1043  pseudouridine synthase  34.74 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  28.06 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3012  RluA family pseudouridine synthase  30.3 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17598  normal  0.601739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.94 
 
 		 334 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  35.51 
 
 		 305 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1348  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.628416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  33.16 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  29.8 
 
 		 298 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3106  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.2 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.774477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2314  pseudouridine synthase, RluD  29.81 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.77 
 
 		 333 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0238  23S rRNA pseudouridine synthase D  29.8 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.846353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  31.56 
 
 		 303 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0367  23S rRNA pseudouridine synthase D  25.91 
 
 		 321 aa  99.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2893  pseudouridine synthase  32.81 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3178  pseudouridine synthase, RluA family  30.92 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  30.49 
 
 		 318 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2875  RluA family pseudouridine synthase  30.54 
 
 		 369 aa  99  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  33.33 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  29.15 
 
 		 325 aa  98.2  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.97 
 
 		 333 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0565  RluA family pseudouridine synthase  30.43 
 
 		 306 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.789528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  33.51 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  28.97 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2390  pseudouridine synthase, RluA family  32.46 
 
 		 302 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.837448  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  31.96 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.64 
 
 		 325 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  31.44 
 
 		 330 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.66 
 
 		 356 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1521  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  32.77 
 
 		 399 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  31.4 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.95 
 
 		 318 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  31.35 
 
 		 362 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  33.67 
 
 		 323 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29 
 
 		 313 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  28.62 
 
 		 578 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  28.57 
 
 		 315 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01440  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.96 
 
 		 327 aa  95.5  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2879  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.5 
 
 		 326 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.206538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2858  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.5 
 
 		 326 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0524542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2991  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.5 
 
 		 326 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2774  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.5 
 
 		 326 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00023272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2877  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.5 
 
 		 326 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 551 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3835  23S rRNA pseudouridine synthase D  27 
 
 		 326 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000664381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  27.21 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  33.16 
 
 		 341 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2880  23S rRNA pseudouridine synthase D  27 
 
 		 326 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0196126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  33.18 
 
 		 306 aa  94.4  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1158  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  30.04 
 
 		 299 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02484  23S rRNA pseudouridine synthase  27 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.174607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1078  pseudouridine synthase, RluA family  27 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0318  pseudouridine synthase  34.22 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02448  hypothetical protein  27 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.166137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3138  pseudouridine synthase  33.5 
 
 		 549 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  30.13 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  29.29 
 
 		 352 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2752  23S rRNA pseudouridine synthase D  27 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000325368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  28.57 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  30.36 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  32.61 
 
 		 370 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 551 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2180  pseudouridine synthase, RluA family  27.7 
 
 		 327 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  37.44 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2975  23S rRNA pseudouridine synthase D  27 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0427325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1087  23S rRNA pseudouridine synthase D  27 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.097503  decreased coverage  0.000000284548 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  28.29 
 
 		 541 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2748  23S rRNA pseudouridine synthase D  26.5 
 
 		 326 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0255935  normal  0.237135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  33.49 
 
 		 339 aa  93.2  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  31.03 
 
 		 352 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  31.61 
 
 		 352 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  27.12 
 
 		 319 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  33.04 
 
 		 319 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  26.11 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  32.26 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2034  pseudouridine synthase, RluA family  30.11 
 
 		 340 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0680786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3915  23S rRNA pseudouridine synthase D  26.34 
 
 		 324 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3265  pseudouridine synthase, RluA family protein  30.05 
 
 		 322 aa  92.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0664  23S rRNA pseudouridine synthase D  27.27 
 
 		 324 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0008107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  30.54 
 
 		 310 aa  92.4  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>