More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0318 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0318  pseudouridine synthase  100 
 
 
302 aa  592  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.78 
 
 
327 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.07 
 
 
300 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.37 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  30.07 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2435  pseudouridine synthase, RluA family  34.06 
 
 
319 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0310  RluA family pseudouridine synthase  30.2 
 
 
303 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.38 
 
 
330 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2837  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.31 
 
 
436 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0449259  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  31.58 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.44 
 
 
313 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1414  RluA family pseudouridine synthase  29.62 
 
 
324 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.2 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  33.54 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1358  pseudouridine synthase, RluA family  34.3 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.03 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1224  pseudouridylate synthase  29.23 
 
 
324 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00465403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2677  pseudouridine synthase, RluA family  34.19 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  30.89 
 
 
313 aa  116  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.8 
 
 
348 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  31.86 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0893  pseudouridine synthase, RluA family  23.81 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  29.56 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  30.1 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  32.19 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2261  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.12 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22770  pseudouridine synthase, RluA family  37.21 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2710  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.22 
 
 
368 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1884  pseudouridine synthase, RluA family  31.86 
 
 
329 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0958449  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  32.2 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  30.84 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  30.3 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.2 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  32.49 
 
 
330 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  31.76 
 
 
344 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.47 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0090  pseudouridine synthase, RluA family  30.43 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.768556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1312  RluA family pseudouridine synthase  30.97 
 
 
350 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2086  pseudouridine synthase, RluA family  31.76 
 
 
330 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.140778  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  32.49 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0919  RluA family pseudouridine synthase  28.09 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.976861  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  31.41 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.41 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.32 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  32.53 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.46 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  31.42 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2789  RluA family pseudouridine synthase  24.77 
 
 
346 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0164  RluA family pseudouridine synthase  34.62 
 
 
324 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.39 
 
 
328 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  30.77 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  30.45 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  31.1 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  33.09 
 
 
310 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  32.28 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  28.88 
 
 
468 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  28.88 
 
 
468 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  32.09 
 
 
346 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  31.44 
 
 
330 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 
400 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  40.15 
 
 
298 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1648  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.15 
 
 
327 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  32.66 
 
 
325 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.59 
 
 
339 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0390  RluA family pseudouridine synthase  31.19 
 
 
339 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.05 
 
 
313 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  29.33 
 
 
330 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  31.33 
 
 
326 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.21 
 
 
334 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.41 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.48 
 
 
391 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  29.68 
 
 
319 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  32.41 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  32.28 
 
 
339 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  32.41 
 
 
402 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.25 
 
 
352 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1476  pseudouridine synthase  33.22 
 
 
360 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  29.8 
 
 
323 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  32.11 
 
 
353 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.33 
 
 
308 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  32.41 
 
 
407 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  32.41 
 
 
405 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3353  RNA pseudouridine synthase family protein  32.72 
 
 
296 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  32.58 
 
 
431 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.33 
 
 
318 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.91 
 
 
332 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.4 
 
 
318 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2133  RluA family pseudouridine synthase  29.04 
 
 
318 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.01 
 
 
326 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  32.1 
 
 
360 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0771  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.68 
 
 
323 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.497941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.14 
 
 
308 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.97 
 
 
308 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000579613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  28.57 
 
 
446 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3840  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.6 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.79 
 
 
320 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  38.85 
 
 
301 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1065  pseudouridine synthase, RluD  31.71 
 
 
328 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.901288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.07 
 
 
438 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  33.57 
 
 
278 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>