More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1296 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1416  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  98.14 
 
 		 322 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  100 
 
 		 322 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0445  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  97.52 
 
 		 322 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0609  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  61.11 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0509  P-protein  55.73 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  54.34 
 
 		 323 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1289  RluA family pseudouridine synthase  52.29 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0438774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  51.37 
 
 		 323 aa  301  9e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0639  pseudouridine synthase, RluA family  47.2 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0783  pseudouridine synthase, RluD  47.06 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  40.98 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  38.85 
 
 		 311 aa  185  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  37.97 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  38.51 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  37.06 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  35.96 
 
 		 305 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  38.34 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  38.59 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  39.65 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  36.77 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.98 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.74 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.83 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  37.62 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  34.71 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  35.64 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.54 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.21 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  34.76 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  37.19 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  35.93 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.39 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  37.62 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.16 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.67 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  37.24 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  36.9 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  35.43 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.9 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  36.9 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.9 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  37.95 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.9 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.9 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.68 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.55 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.82 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.99 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  37.42 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  37.24 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  35.83 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  34.59 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  33.88 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.2 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.77 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.52 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  35.08 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  35.62 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.78 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.64 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  35.27 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  34.78 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  33.23 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  38.02 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  34.93 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  34.32 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.11 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  35.43 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  35.47 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  36.14 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  35.03 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.33 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  32.9 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  36.64 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1417  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.79 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  34.78 
 
 		 343 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  34.69 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  34.45 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  33.55 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.64 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  33.1 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.54 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  36.3 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  34.47 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.6 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  35.29 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  33.67 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  34.16 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  33.11 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  31.67 
 
 		 541 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  33.23 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  31.73 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  32.12 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  33.45 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.84 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  35.35 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  32.31 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>