125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4504 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  100 
 
 		 320 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  87.81 
 
 		 320 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  48.9 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  30.15 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  29.85 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  28.03 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  28.03 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  29.48 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  31 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  27.88 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  27.95 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  29.7 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  25.23 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 632 aa  59.7  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.32 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  27.92 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 1301 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  40.51 
 
 		 178 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 878 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 685 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 1032 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 		 1265 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 758 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 991 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 896 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2259  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 582 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  27.14 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 1045 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  31.63 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  36.9 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2038  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.55 
 
 		 554 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0938493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 921 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 765 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  44.83 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 456 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 759 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 637 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 769 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 603 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 		 812 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 766 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 789 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 544 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.4 
 
 		 563 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 768 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2298  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.1 
 
 		 569 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.9 
 
 		 452 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 450 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003584  putative chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 157 aa  45.8  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 473 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 771 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 901 aa  45.8  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4376  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  28.87 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0457  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 578 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.809625  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  39.66 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1325 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 593 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02545  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  27.4 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4836  DNA binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  29.5 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 849 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1425 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 596 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  38.6 
 
 		 474 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 653 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1513 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 1078 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  41.07 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 666 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  29.5 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5144  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 150 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.495356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3728  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.439666  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  29.5 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  29.5 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  29.5 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  29.5 
 
 		 481 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0934  putative chemotaxis protein CheY  43.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0812215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 862 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>