117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7079 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  49.21 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  48.9 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  30.99 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  30.99 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  30.22 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  31.32 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  31.64 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  30.82 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  29.09 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  29.09 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  28.86 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  31.85 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 878 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 448 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.87 
 
 		 448 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.87 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  31.58 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.85 
 
 		 479 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 		 637 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  35.63 
 
 		 461 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3209  putative chemotaxis protein CheY  34.04 
 
 		 157 aa  49.3  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.62967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0640  two component LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 758 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 619 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 460 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0996419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 1032 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 1039 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  34.57 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 886 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 452 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 		 1265 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 603 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 656 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 		 477 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 		 444 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 524 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1300 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 783 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 474 aa  45.8  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 473 aa  45.8  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 759 aa  45.8  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  39.66 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  27.69 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  40.32 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 896 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1325 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 789 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1807  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  25.43 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  40 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  39.66 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  39.66 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 768 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4590  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.038066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0369  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 991 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  40.58 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 765 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 769 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 763 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  39.06 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 146 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  26.24 
 
 		 146 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 660 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.03 
 
 		 400 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 1253 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 1111 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2340  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  32.1 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0371017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2298  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.33 
 
 		 569 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0619  two component LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 258 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738447 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 753 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  39.71 
 
 		 812 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0574  LuxR family DNA-binding response regulator  29.87 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4376  LuxR response regulator receiver  31.82 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 657 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.21 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0613  two component LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0682847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0457  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.71 
 
 		 578 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.809625  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 873 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 		 849 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2342  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  30.86 
 
 		 157 aa  42.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0482174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 653 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 766 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4588  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.71 
 
 		 567 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  30.08 
 
 		 622 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 622 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 764 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1513 aa  42.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1426 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>