More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3209 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3209  putative chemotaxis protein CheY  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.62967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003584  putative chemotaxis protein CheY  65.61 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0934  putative chemotaxis protein CheY  64.33 
 
 		 158 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0812215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02545  hypothetical protein  64.71 
 
 		 178 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2342  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  53.5 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0482174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0857  response regulator receiver protein  53.5 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.60456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2340  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  52.23 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0371017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02626  hypothetical protein  41.03 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003751  response regulator  39.74 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.562532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0725  response regulator  42.48 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.836787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  37.4 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  38.33 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.64 
 
 		 565 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.5 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  36.36 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  39.5 
 
 		 553 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 479 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 491 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  33.06 
 
 		 491 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1190  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.09 
 
 		 560 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  unclonable  0.0000120152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  43.48 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1097  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 554 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6098  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.21 
 
 		 553 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1086  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 554 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.667334  normal  0.027498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1070  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 554 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  50.77 
 
 		 431 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  35.59 
 
 		 438 aa  67.8  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1342  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 556 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 806 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4576  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.54 
 
 		 553 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494559  normal  0.955166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  36.29 
 
 		 557 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  34.71 
 
 		 270 aa  67  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4588  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 		 567 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1371  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.858891  normal  0.520575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  32.79 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.42 
 
 		 567 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 470 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  34.71 
 
 		 557 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 439 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1465 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 622 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 472 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 472 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  38.79 
 
 		 622 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  31.67 
 
 		 447 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5003  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.82 
 
 		 554 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 473 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  30.25 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2259  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.9 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30830  putative two-component response regulator  40.91 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0592396  hitchhiker  0.000000000000489784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  39.77 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  34.71 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  38.14 
 
 		 439 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  31.54 
 
 		 823 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  36.44 
 
 		 484 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  38.14 
 
 		 481 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 622 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.25 
 
 		 1172 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 		 358 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 324 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 469 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 628 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 469 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  37.07 
 
 		 1111 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  34.75 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 1156 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  36.75 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  30.71 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0406  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.62 
 
 		 557 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0605  response regulator  29.03 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  28.86 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  33.33 
 
 		 456 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2038  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.4 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0938493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  33.87 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0457  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.76 
 
 		 578 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.809625  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  35.9 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3962  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  35.9 
 
 		 518 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  35.9 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  35.9 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 395 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  35.9 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  35.9 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 456 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>