237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2657 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  708    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  708    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  38.07 
 
 
333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  33.44 
 
 
349 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  32.84 
 
 
348 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  32.34 
 
 
345 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  32.34 
 
 
345 aa  175  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  32.33 
 
 
345 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  30.99 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  28.03 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  28.8 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  29.21 
 
 
342 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  26.3 
 
 
328 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  24.63 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  24.46 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
1032 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  31.53 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
783 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  46.55 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  36.47 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
530 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
1325 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
657 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
656 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1465 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  34.02 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
984 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  35.44 
 
 
438 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
473 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
812 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
765 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  44.83 
 
 
456 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
593 aa  49.7  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
456 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.98 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0934  putative chemotaxis protein CheY  34.41 
 
 
158 aa  49.3  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0812215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  44.83 
 
 
1113 aa  49.3  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2727  response regulator receiver protein  36.9 
 
 
380 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
653 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4689  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.67 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3209  putative chemotaxis protein CheY  35.05 
 
 
157 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.62967  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
909 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
1078 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.26 
 
 
1414 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  23.15 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  31.13 
 
 
492 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 
669 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  39.66 
 
 
441 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
896 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003584  putative chemotaxis protein CheY  34.09 
 
 
157 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  37.66 
 
 
154 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4751  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0259995  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  38.46 
 
 
353 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
142 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5378  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
233 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287467  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  31.31 
 
 
434 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
1439 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
516 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  33.93 
 
 
746 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
473 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  32.1 
 
 
484 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  38.98 
 
 
849 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
901 aa  47  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1258  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  37.65 
 
 
451 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
268 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1419  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.65 
 
 
451 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 
444 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.21 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
527 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.21 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  38.03 
 
 
200 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2566  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
369 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.236818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
500 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.21 
 
 
448 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2541  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.98 
 
 
438 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281957  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 
285 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
862 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  38.24 
 
 
451 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1427  response regulator receiver protein  38.71 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1766  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 
311 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.143421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1776  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.94 
 
 
455 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227849  normal  0.279906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
368 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
771 aa  46.2  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  28.44 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
477 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2737  two component response regulator transcription regulator protein  42.37 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3995  helix-turn-helix, Fis-type  44.9 
 
 
444 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0385153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2645  response regulator  45 
 
 
447 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0366662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  41.07 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
1425 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>