31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5019 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  63.11 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  60.67 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  60.12 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  30.63 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  26.3 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  26.3 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  28.74 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  28.96 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  28.96 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  33.14 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  31.35 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  28.47 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  25.23 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 1465 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 746 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 		 560 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3728  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 395 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.439666  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 643 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  28.28 
 
 		 285 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 596 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 896 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3109  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 493 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  37.5 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  30.97 
 
 		 329 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>