193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2734 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 345 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  93.33 
 
 		 345 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  93.33 
 
 		 345 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  66.86 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  65.01 
 
 		 349 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  37.91 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  32.33 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  32.33 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  30.04 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  31.64 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  28.74 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  26.87 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  23.23 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 646 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.75 
 
 		 227 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  27.92 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  38.96 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.58 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  36.71 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1808 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 771 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  35.14 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2259  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 		 582 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.08 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  35.45 
 
 		 557 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 473 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 765 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3478  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  33.59 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 641 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 570 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.93 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1111 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  44.64 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1739  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.31 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3430  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 231 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2719  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  25.25 
 
 		 457 aa  46.6  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0512  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00189837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 204 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1435  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 445 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0274365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2727  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  32.69 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.88 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.66 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1371  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 		 582 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.858891  normal  0.520575 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.64 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 901 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.66 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3199  response regulator receiver protein  37.21 
 
 		 126 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.353432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4068  response regulator receiver  34.15 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.706307  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 758 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.68 
 
 		 980 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 1426 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  22.56 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  34.12 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.47 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  29.07 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  35 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5905  two-component response regulator  26.39 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.69 
 
 		 1374 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03680  C4 dicarboxylate two-component response regulator, sigma54-dependent; DctD2  31.62 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105245  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  33.33 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 1714 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  31.07 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2880  two-component response regulator  36.07 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00422534  decreased coverage  0.000115305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 887 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  29.58 
 
 		 557 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5003  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.75 
 
 		 554 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  31.18 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>