143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0017 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0017  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2788  hypothetical protein  38.07 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2657  hypothetical protein  38.07 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2734  response regulator transcription regulator protein  37.91 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2827  response regulator receiver  36.06 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210886  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2563  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2966  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2973  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0823  response regulator receiver domain-containing protein  32.22 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7079  response regulator receiver domain-containing protein  30.82 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4504  response regulator receiver protein  31 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3514  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5019  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.618067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4354  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4047  response regulator receiver domain-containing protein  30.2 
 
 		 350 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2547  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4404  response regulator receiver domain-containing protein  23.68 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1465 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0692  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  42.47 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  31.75 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 746 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2259  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 		 582 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 765 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2450  putative two-component response regulator  38.18 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 593 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0287  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 984 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 456 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  30.65 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  40.43 
 
 		 196 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  37.04 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2085  response regulator  37.29 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 560 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  32.71 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 		 632 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 813 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  36.84 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  38.6 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  37.04 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3236  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 725 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0648  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2722  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3364  hydrogenase accessory protein HypB  39.29 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 657 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  36.67 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0507  HupR response regulator  37.5 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 		 812 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 619 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00791251  normal  0.142838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 530 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 		 783 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 1325 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 187 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 769 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 446 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 439 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  43.1 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0605  response regulator  36.67 
 
 		 536 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3936  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 441 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 1032 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 653 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 685 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 		 1265 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 		 458 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.84 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  38.24 
 
 		 563 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68250  two-component response regulator  27.65 
 
 		 462 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371358  normal  0.144717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1086  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.38 
 
 		 554 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.667334  normal  0.027498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  35.71 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>