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for query gene Bfae_30480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
559 aa  1036    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.94 
 
 
541 aa  356  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.96 
 
 
551 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 
551 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.29 
 
 
532 aa  343  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.37 
 
 
539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.61 
 
 
550 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.48 
 
 
534 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.43 
 
 
540 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 
512 aa  208  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.04 
 
 
534 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
507 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
607 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  30.82 
 
 
525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.57 
 
 
478 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.57 
 
 
484 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
788 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 
522 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
522 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.58 
 
 
529 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
532 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 
510 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.48 
 
 
609 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 
521 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 
458 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 
502 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 
516 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.63 
 
 
489 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 
522 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  33.58 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 
531 aa  190  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 
521 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.67 
 
 
469 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.53 
 
 
478 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  35.23 
 
 
469 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  35.3 
 
 
528 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
487 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.65 
 
 
519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  38.89 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
646 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
646 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
486 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 
646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 
494 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
483 aa  183  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 
546 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  31.47 
 
 
579 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 
488 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.47 
 
 
525 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.74 
 
 
467 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.97 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 
520 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.55 
 
 
582 aa  180  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
588 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 
519 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 
493 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.29 
 
 
509 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.47 
 
 
508 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
516 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 
474 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 
478 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
458 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2521  major facilitator transporter  35.08 
 
 
497 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
626 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
504 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 
539 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 
763 aa  176  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.31 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.16 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 
515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.99 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 
485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  33.49 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.33 
 
 
490 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.19 
 
 
522 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.63 
 
 
534 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  34.23 
 
 
519 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 
587 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 
527 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_6465  transporter  33.91 
 
 
484 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
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NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
513 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
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