More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0669 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  47.56 
 
 		 182 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  48.41 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  47.4 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  47.77 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  51.02 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  50.34 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  45.68 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 185 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  48.57 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  45.96 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  40.79 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  46.88 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 153 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  42.58 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.72 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.94 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  45.89 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  48.95 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  48.55 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  48.95 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  48.95 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.95 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  47.18 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  44.67 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  45.75 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  49.29 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  48.25 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  45.86 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  49.29 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  52.14 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  48.72 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  47.55 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  46.54 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  43.57 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  44.16 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  47.55 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.32 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.68 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  46.25 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>