More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0789 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 155 aa  314  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  70.39 
 
 		 154 aa  233  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  69.54 
 
 		 159 aa  226  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  66.67 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  66.89 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  66.43 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  63.4 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  62.09 
 
 		 176 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  65.54 
 
 		 157 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  62.25 
 
 		 152 aa  207  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  61.21 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  63.09 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  63.76 
 
 		 185 aa  204  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  63.76 
 
 		 185 aa  204  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 185 aa  203  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  62 
 
 		 158 aa  201  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  65.49 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  61.38 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  63.83 
 
 		 161 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  59.35 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  63.12 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  59.35 
 
 		 160 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  62.41 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  58.82 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  56.86 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  60.26 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  51.75 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  53.68 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.3 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  51.41 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.57 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.18 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  50.66 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  50.66 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 155 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  48.39 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>