More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1418 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  61.04 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 153 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  193  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  55.63 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 159 aa  180  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  53.06 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 		 148 aa  175  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  51.35 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  50.97 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  53.9 
 
 		 163 aa  166  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  54.29 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  43.79 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  44.81 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  48.03 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.05 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 174 aa  152  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48.05 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.05 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  44.16 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  43.71 
 
 		 184 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  50.7 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  47.18 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  47.33 
 
 		 152 aa  147  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 		 175 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  45.1 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  46.1 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  45.7 
 
 		 183 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  45.58 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>