More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5296 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  86.71 
 
 		 186 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  82.21 
 
 		 177 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  85.71 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  74.86 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  75.43 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  69.23 
 
 		 182 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  65.92 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  72.37 
 
 		 161 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  75 
 
 		 162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  70.39 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  70.39 
 
 		 160 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  69.43 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  74.15 
 
 		 154 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  68.79 
 
 		 160 aa  228  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  69.08 
 
 		 160 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  71.14 
 
 		 158 aa  224  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  69.8 
 
 		 158 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  71.14 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  71.14 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  71.14 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  68.42 
 
 		 160 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  68.21 
 
 		 158 aa  222  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  68.21 
 
 		 158 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  70.34 
 
 		 157 aa  221  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  68.75 
 
 		 161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  69.08 
 
 		 152 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  64.71 
 
 		 160 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  61.21 
 
 		 155 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 		 151 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 155 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  62.34 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 154 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 155 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 155 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 155 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  59.88 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  62.24 
 
 		 159 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  164  9e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  155  4e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 153 aa  151  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.32 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 153 aa  148  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 		 151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  49.33 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.8 
 
 		 162 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 151 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  47.33 
 
 		 151 aa  141  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 158 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  48.57 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  46.47 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 152 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 147 aa  138  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 159 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>