More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3233 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  314  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  98.11 
 
 
159 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  96.86 
 
 
159 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  96.86 
 
 
159 aa  283  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  96.23 
 
 
159 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  96.23 
 
 
159 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  95.6 
 
 
159 aa  278  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  94.34 
 
 
159 aa  274  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  94.34 
 
 
159 aa  274  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  94.67 
 
 
164 aa  267  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  91.25 
 
 
160 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  91.25 
 
 
160 aa  261  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  65.58 
 
 
155 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  65.1 
 
 
149 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  66.44 
 
 
154 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 
148 aa  206  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  64.38 
 
 
154 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  64.38 
 
 
154 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 
147 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 
149 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 
149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 
149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  60.4 
 
 
149 aa  197  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  62.42 
 
 
149 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 
149 aa  194  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  60.39 
 
 
154 aa  193  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  58.94 
 
 
151 aa  193  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 
173 aa  193  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  65.28 
 
 
147 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 
147 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 
148 aa  190  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 
170 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  58.39 
 
 
149 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  58.71 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
148 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  56.49 
 
 
154 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  58.62 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  55.48 
 
 
155 aa  177  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  55.19 
 
 
154 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 
149 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  55.19 
 
 
175 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  54.55 
 
 
154 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  56.96 
 
 
159 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  52.94 
 
 
156 aa  174  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  57.24 
 
 
172 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 
154 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 
149 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  55.77 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  55.19 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  54.55 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  54.55 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 
149 aa  171  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 
154 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
154 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
150 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  53.25 
 
 
154 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
149 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
174 aa  168  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
149 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
149 aa  167  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
181 aa  167  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  55.86 
 
 
172 aa  167  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
177 aa  166  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 
165 aa  166  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 
157 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 
157 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  55.63 
 
 
152 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
150 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
150 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
149 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
149 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  57.86 
 
 
156 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 
150 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 
149 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  50.31 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 
156 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  52.41 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  55.86 
 
 
155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
153 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 
149 aa  160  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>