More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0352 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  49.66 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  50.68 
 
 		 182 aa  169  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 176 aa  166  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 186 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  46.62 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  43.84 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 160 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  153  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  45.14 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 156 aa  136  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 175 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  45.27 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  42.95 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  42.95 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  41.61 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  42.95 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  41.5 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 181 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 177 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  43.06 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  43.38 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  43.38 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  43.06 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  43.06 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0835  ATP-cone domain protein  45.83 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  39.19 
 
 		 159 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  38.78 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>