More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2909 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  77.33 
 
 		 182 aa  240  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  76.51 
 
 		 161 aa  233  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  73.15 
 
 		 186 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  74.5 
 
 		 176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  75 
 
 		 193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  70.67 
 
 		 155 aa  230  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  76.51 
 
 		 160 aa  229  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  77.18 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  75.17 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  69.08 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  75.17 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  75.17 
 
 		 161 aa  227  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  75.68 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  70.2 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  70.39 
 
 		 157 aa  224  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  71.81 
 
 		 152 aa  222  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  70.95 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  71.81 
 
 		 154 aa  221  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  70.34 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  68.42 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  68.42 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  70.75 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  67.11 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  63.64 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 		 155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  62.58 
 
 		 161 aa  212  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  65.13 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  65.77 
 
 		 178 aa  206  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  48.08 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  51.66 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  51.66 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  53.38 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  50.94 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  47.44 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 148 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 147 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>