More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3957 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  349  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  82.21 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  77.9 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  75.14 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  77.78 
 
 		 185 aa  264  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  79.87 
 
 		 186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  67.8 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  67.44 
 
 		 176 aa  231  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  68.35 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  71.43 
 
 		 154 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  70.86 
 
 		 157 aa  222  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  68.79 
 
 		 161 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  70.95 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 158 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 158 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  68.15 
 
 		 160 aa  220  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  69.59 
 
 		 160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  68.92 
 
 		 158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 160 aa  218  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  68.92 
 
 		 160 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  68.24 
 
 		 160 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 155 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 152 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 157 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  66.67 
 
 		 161 aa  210  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  69.39 
 
 		 151 aa  208  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 158 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 158 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  60.62 
 
 		 155 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 156 aa  198  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  61.33 
 
 		 154 aa  197  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  60.26 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  59.87 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  59.87 
 
 		 155 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  59.87 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  60.4 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  59.87 
 
 		 178 aa  190  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 151 aa  148  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 152 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.35 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  44.75 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  44.63 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 147 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 156 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  45.4 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  46.3 
 
 		 184 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>