More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0185 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  88.74 
 
 		 153 aa  280  6.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  50.98 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 160 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  49.66 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  48.37 
 
 		 176 aa  158  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  47.71 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  47.62 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  46.26 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  43.79 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  46.36 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  43.33 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  45.14 
 
 		 161 aa  136  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  45.58 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  43.75 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  40.94 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>