More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1536 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  100 
 
 
161 aa  332  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  67.36 
 
 
185 aa  215  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  68.75 
 
 
193 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  63.35 
 
 
185 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  66 
 
 
157 aa  215  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  67.36 
 
 
185 aa  215  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  61.11 
 
 
176 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  62.58 
 
 
162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  69.18 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  66.67 
 
 
177 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 
155 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
155 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
155 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  67.81 
 
 
156 aa  207  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 
155 aa  207  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  65.75 
 
 
158 aa  207  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 
186 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  65.07 
 
 
157 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  63.19 
 
 
154 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  63.01 
 
 
182 aa  202  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  63.7 
 
 
158 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  63.7 
 
 
158 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  62.5 
 
 
158 aa  201  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  61.04 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  61.04 
 
 
158 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  64.58 
 
 
160 aa  197  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  61.38 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  62.5 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  58.97 
 
 
161 aa  194  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  62.86 
 
 
160 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  62.5 
 
 
151 aa  194  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  63.57 
 
 
160 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  62.14 
 
 
161 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  58.97 
 
 
160 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  56.21 
 
 
159 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  62.86 
 
 
160 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  59.44 
 
 
154 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  61.43 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 
178 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 
150 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 
154 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 
154 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
149 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 
149 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 
149 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
153 aa  154  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 
155 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  47.95 
 
 
147 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
156 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
151 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 
149 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  50 
 
 
172 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  54.79 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  46.58 
 
 
154 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 
148 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 
149 aa  150  7e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  46.58 
 
 
147 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  50.7 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  52.05 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 
158 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  51.05 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  53.42 
 
 
159 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  48.94 
 
 
149 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 
153 aa  143  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 
149 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
149 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 
154 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  47.95 
 
 
150 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 
148 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  47.18 
 
 
173 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 
173 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 
154 aa  141  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 
153 aa  141  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  48.63 
 
 
152 aa  141  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  52.05 
 
 
159 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  52.74 
 
 
159 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.14 
 
 
148 aa  141  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  50 
 
 
172 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  46.58 
 
 
147 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 
149 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 
154 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.57 
 
 
162 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 
154 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 
154 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>