More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0989 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  96.03 
 
 		 152 aa  296  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  74.32 
 
 		 174 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  67.57 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 		 175 aa  177  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 175 aa  177  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  53.69 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  48.67 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.66 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 150 aa  157  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  54.3 
 
 		 176 aa  157  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 162 aa  156  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  53.68 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 184 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  51.02 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  48.95 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  43.33 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  50.75 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  47.65 
 
 		 162 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  48.3 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  47.97 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.86 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  46.71 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  48.3 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>