More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1549 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  100 
 
 
163 aa  321  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  57.33 
 
 
151 aa  193  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  58.28 
 
 
153 aa  191  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  58.6 
 
 
158 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  54.84 
 
 
158 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  58.28 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 
150 aa  186  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  55.19 
 
 
154 aa  184  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
156 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
149 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
153 aa  177  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  59.06 
 
 
153 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  59.86 
 
 
150 aa  176  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
159 aa  175  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  56.58 
 
 
153 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  56.67 
 
 
157 aa  174  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  56.58 
 
 
153 aa  174  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  58.71 
 
 
162 aa  173  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  56.77 
 
 
156 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 
154 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 
155 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 
155 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 
150 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
150 aa  167  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
150 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 
154 aa  166  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
150 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  52.17 
 
 
156 aa  164  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
150 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  163  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  52.83 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  52.69 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  51.53 
 
 
159 aa  160  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
152 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
150 aa  160  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  52.63 
 
 
163 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 
148 aa  158  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
150 aa  158  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
156 aa  158  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
156 aa  158  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
152 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
154 aa  157  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
155 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  54.55 
 
 
154 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  54.55 
 
 
175 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  53.02 
 
 
154 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  49.37 
 
 
158 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  49.68 
 
 
155 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  51.3 
 
 
154 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 
184 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  54 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  47.47 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  46.41 
 
 
175 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  58.94 
 
 
154 aa  154  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 
157 aa  153  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
154 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
152 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 
157 aa  153  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
148 aa  153  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 
157 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 
173 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  53.25 
 
 
154 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 
175 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  52.6 
 
 
154 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  52.6 
 
 
154 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
159 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
154 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
147 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  52.56 
 
 
153 aa  151  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
183 aa  150  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  52.11 
 
 
159 aa  150  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 
193 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
149 aa  150  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  150  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
159 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  150  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
159 aa  150  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.5904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>