More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4277 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  69.23 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  66.85 
 
 		 176 aa  245  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  77.7 
 
 		 186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  67.8 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  77.33 
 
 		 162 aa  240  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  76.51 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  76.51 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  77.55 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  71.43 
 
 		 161 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  70.44 
 
 		 160 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  72.08 
 
 		 160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  72.08 
 
 		 160 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  73.65 
 
 		 161 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  72.97 
 
 		 160 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  72.97 
 
 		 160 aa  225  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  69.59 
 
 		 158 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  69.59 
 
 		 158 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  68.92 
 
 		 158 aa  224  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  71.24 
 
 		 154 aa  224  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  68.87 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  68.87 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  70.14 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  66.25 
 
 		 158 aa  221  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  63.23 
 
 		 155 aa  213  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 154 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  64.67 
 
 		 155 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  67.35 
 
 		 152 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 155 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 151 aa  207  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  65.1 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  63.09 
 
 		 155 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  62.67 
 
 		 156 aa  205  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  60.9 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  63.01 
 
 		 161 aa  202  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 154 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  162  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 150 aa  156  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 153 aa  156  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  48.99 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 148 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 155 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 155 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.01 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  47.56 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 148 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  49.01 
 
 		 153 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  141  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 148 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  45.29 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  49.31 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  43.59 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  43.59 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 151 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.31 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  138  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>