More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0157 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  65.1 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 154 aa  183  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  55.78 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 150 aa  173  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  52.7 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 162 aa  169  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  52.35 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  54.42 
 
 		 163 aa  167  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.68 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  52.35 
 
 		 176 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 150 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  53.06 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 157 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  52.7 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 165 aa  158  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  49.66 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 180 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 175 aa  156  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  51.7 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>