More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2939 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 147 aa  296  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  68.03 
 
 		 147 aa  217  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  67.35 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 154 aa  209  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  62.59 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 149 aa  200  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  60.54 
 
 		 149 aa  191  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 170 aa  189  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  65.99 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  65.99 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  65.99 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  65.31 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 160 aa  186  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 159 aa  184  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  61.11 
 
 		 165 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  59.86 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  57.24 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  56.94 
 
 		 170 aa  170  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  55.71 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 154 aa  166  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  55 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  55 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  55.86 
 
 		 172 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  54.17 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  54.17 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 173 aa  157  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 		 149 aa  156  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 		 149 aa  156  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>