More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0280 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  96.62 
 
 		 148 aa  267  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  69.39 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 155 aa  222  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  68.92 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 154 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  70.07 
 
 		 154 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  63.51 
 
 		 149 aa  202  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  64.19 
 
 		 149 aa  202  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 170 aa  200  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 149 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  62.16 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 159 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 159 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 149 aa  185  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  57.82 
 
 		 147 aa  184  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 		 159 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  55.41 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 153 aa  167  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  52.03 
 
 		 170 aa  166  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 149 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  51.02 
 
 		 172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  52.14 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 174 aa  157  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  51.02 
 
 		 162 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 150 aa  156  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>