More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1916 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
148 aa  304  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 
154 aa  199  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 
159 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 
158 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  57.64 
 
 
155 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 
151 aa  180  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
157 aa  179  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
157 aa  179  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
147 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
149 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
175 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
154 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
149 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
149 aa  178  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  57.14 
 
 
147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  57.43 
 
 
172 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 
149 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 
149 aa  176  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
165 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  59.03 
 
 
161 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  56.94 
 
 
154 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
154 aa  174  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
147 aa  175  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 
154 aa  174  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  54.86 
 
 
149 aa  173  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  55.78 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  55.56 
 
 
154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  54.05 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 
174 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 
159 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
154 aa  169  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
159 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 
149 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 
149 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.35 
 
 
170 aa  168  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
160 aa  167  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
149 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 
149 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
148 aa  167  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
159 aa  167  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 
149 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
155 aa  166  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
149 aa  166  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
149 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
149 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
165 aa  164  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
160 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
149 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 
170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
181 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  51.39 
 
 
156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  52.03 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
177 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
149 aa  160  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
152 aa  160  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
157 aa  160  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>