More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2142 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 152 aa  311  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2471  transcriptional regulator NrdR  98.03 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.01116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  83.55 
 
 		 153 aa  270  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  59.86 
 
 		 154 aa  195  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  60.54 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  59.03 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  59.03 
 
 		 154 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  59.03 
 
 		 154 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  59.03 
 
 		 154 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 155 aa  189  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  55.78 
 
 		 151 aa  189  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  57.64 
 
 		 154 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  55.92 
 
 		 157 aa  186  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  57.64 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  57.89 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  57.89 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 174 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  56.94 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  56.94 
 
 		 170 aa  179  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  54.05 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  55.78 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 165 aa  174  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0792  transcriptional regulator NrdR  53.95 
 
 		 155 aa  161  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0763  transcriptional regulator NrdR  53.29 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 148 aa  160  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 173 aa  153  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>