More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0576 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  78.79 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  80.12 
 
 		 181 aa  262  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04403  transcriptional regulator NrdR  81.88 
 
 		 162 aa  248  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  58.17 
 
 		 156 aa  192  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  59.48 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  59.33 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  60.26 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  58 
 
 		 154 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 154 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 149 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  59.18 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  56.49 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  56.49 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 149 aa  184  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 154 aa  184  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 149 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  55.15 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  61.49 
 
 		 155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  64.43 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  61.94 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  62.09 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  62.09 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  61.29 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 149 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  62.09 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  61.29 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  63.09 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  61.29 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  61.44 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 		 149 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  60.65 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  52.7 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  171  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  54.3 
 
 		 151 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  170  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  170  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  170  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  170  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  170  9e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  52.63 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  168  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 165 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 149 aa  168  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  53.75 
 
 		 163 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  53.75 
 
 		 163 aa  167  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  58.78 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  52.6 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>