More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3169 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  97.3 
 
 		 185 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  92.97 
 
 		 185 aa  322  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  77.78 
 
 		 177 aa  264  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  75.43 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  78.7 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  76.51 
 
 		 182 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  74.32 
 
 		 161 aa  230  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  69.43 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  68.32 
 
 		 176 aa  227  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  72.79 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 161 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  71.62 
 
 		 160 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  70.27 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 160 aa  221  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 160 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  67.5 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 		 158 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 152 aa  218  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  69.39 
 
 		 158 aa  218  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  69.39 
 
 		 158 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  66.88 
 
 		 158 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  67.36 
 
 		 161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  64.9 
 
 		 157 aa  214  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  64.24 
 
 		 158 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  64.24 
 
 		 158 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  65.1 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 155 aa  207  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 		 151 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  63.76 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 156 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  65.99 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 155 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 155 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 155 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 154 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 154 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  59.73 
 
 		 159 aa  191  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  57.59 
 
 		 178 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 150 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  50.92 
 
 		 163 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 156 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  148  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  50.66 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 150 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 148 aa  141  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  141  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 153 aa  141  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  50.71 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 153 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 155 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  43.86 
 
 		 170 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  47.1 
 
 		 154 aa  138  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 150 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 150 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  49.32 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 148 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  50.69 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  46.99 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 147 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>