More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0794 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
148 aa  293  4e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 
159 aa  197  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  64.43 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 
154 aa  175  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  59.09 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
153 aa  166  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 
149 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 
149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
153 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
153 aa  164  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
162 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
153 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  51.35 
 
 
148 aa  159  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
156 aa  157  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
156 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
156 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
156 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
155 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
155 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  50.67 
 
 
155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.68 
 
 
163 aa  153  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
156 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
150 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
150 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
150 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
153 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 
148 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 
150 aa  150  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 
150 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 
174 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
150 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  51.01 
 
 
176 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 
152 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
158 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  53.57 
 
 
150 aa  148  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  44.52 
 
 
175 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
154 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
152 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 
151 aa  146  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  43.84 
 
 
175 aa  146  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  43.45 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50.68 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 
153 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
159 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
158 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
160 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
150 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
147 aa  140  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 
151 aa  140  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  45.27 
 
 
162 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
156 aa  140  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
160 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  42.95 
 
 
182 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
153 aa  139  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  48.59 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  48.59 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  48.59 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
185 aa  137  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
154 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
149 aa  138  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 
157 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 
186 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  46.62 
 
 
177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 
176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
185 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 
185 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
150 aa  137  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 
165 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
158 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
158 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 
193 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
155 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
149 aa  136  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.3 
 
 
149 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 
175 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 
154 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 
151 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 
149 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 
151 aa  135  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>