More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4029 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  67.57 
 
 		 179 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  67.57 
 
 		 179 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  65.54 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  64.47 
 
 		 157 aa  204  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  61.88 
 
 		 158 aa  200  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  63.58 
 
 		 158 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  63.51 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  61.07 
 
 		 159 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  66.23 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0695  transcriptional regulator NrdR  68.92 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331414  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  50.98 
 
 		 159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 159 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  54.42 
 
 		 151 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 151 aa  165  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 158 aa  165  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 154 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 148 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 150 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 155 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 155 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  45.62 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 153 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 152 aa  148  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 157 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  44.81 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 150 aa  144  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  47.71 
 
 		 156 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  42.68 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 151 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  47.77 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 165 aa  138  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  46.3 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  47.13 
 
 		 157 aa  138  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  47.13 
 
 		 157 aa  138  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 155 aa  137  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  42.95 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  44.16 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  40.46 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  46.15 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>