More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2635 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 160 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  97.5 
 
 		 160 aa  313  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  94.38 
 
 		 160 aa  303  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  91.25 
 
 		 160 aa  294  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  89.94 
 
 		 161 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  90 
 
 		 160 aa  290  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  88.2 
 
 		 161 aa  282  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  72.08 
 
 		 182 aa  230  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  70.51 
 
 		 186 aa  229  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  75.17 
 
 		 162 aa  228  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  73.15 
 
 		 176 aa  227  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  69.08 
 
 		 193 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  71.14 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 185 aa  219  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 		 185 aa  219  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  69.74 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  68.24 
 
 		 177 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  64.9 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  64.9 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  66.21 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  64.24 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  65.33 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 151 aa  201  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  64.67 
 
 		 158 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  64.67 
 
 		 158 aa  200  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 		 155 aa  199  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  64 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  63.16 
 
 		 152 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 155 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  61.39 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 155 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 155 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  63.27 
 
 		 155 aa  194  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  63.57 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  60.81 
 
 		 160 aa  191  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  60.13 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 		 154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  59.57 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 153 aa  167  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 155 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50.99 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  50.32 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  49.35 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  49.68 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  47.68 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.22 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  42.76 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2386  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000689968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1550  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.02 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>