More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2529 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
158 aa  315  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  94.94 
 
 
158 aa  303  9.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  94.94 
 
 
158 aa  303  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  76.19 
 
 
154 aa  238  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  72.33 
 
 
160 aa  234  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  70.95 
 
 
157 aa  226  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  67.52 
 
 
158 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  67.52 
 
 
158 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  69.8 
 
 
193 aa  224  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  66.23 
 
 
158 aa  221  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  66.25 
 
 
182 aa  221  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  68.92 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  70 
 
 
186 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  66.88 
 
 
185 aa  216  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 
185 aa  216  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  68.03 
 
 
176 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 
185 aa  216  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  64.19 
 
 
162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 
161 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  63.87 
 
 
160 aa  208  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 
160 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  65.54 
 
 
161 aa  208  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  64.9 
 
 
160 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  64.52 
 
 
160 aa  207  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  64.24 
 
 
160 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  60.65 
 
 
157 aa  203  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  62 
 
 
155 aa  201  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  62.5 
 
 
161 aa  201  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  64.63 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 
152 aa  194  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  61.22 
 
 
155 aa  191  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  59.74 
 
 
155 aa  190  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 
178 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  58.44 
 
 
154 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 
155 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 
155 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 
155 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  56.67 
 
 
154 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  53.9 
 
 
159 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
153 aa  154  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 
153 aa  150  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
149 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
164 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
148 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 
159 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  52.63 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 
154 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 
154 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
154 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
154 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
149 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 
148 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
149 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
158 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
173 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
148 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
149 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
153 aa  140  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 
154 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 
160 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
155 aa  140  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
150 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
150 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  47.62 
 
 
150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
149 aa  137  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2142  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 
152 aa  136  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.497739  hitchhiker  0.00230243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
147 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
151 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  47.1 
 
 
165 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
149 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
157 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
157 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
149 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
149 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
154 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>