More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4090 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  100 
 
 
154 aa  309  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 
153 aa  176  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  56.38 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
149 aa  170  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 
151 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 
149 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  55.48 
 
 
155 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  55.13 
 
 
156 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 
162 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  55.48 
 
 
155 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  53.29 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  53.06 
 
 
150 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 
150 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  54.97 
 
 
153 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 
157 aa  159  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 
150 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
150 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
150 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  54.9 
 
 
153 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  54.67 
 
 
176 aa  157  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
150 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  54.3 
 
 
153 aa  156  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
154 aa  156  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  53.02 
 
 
163 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  56.25 
 
 
156 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  52.94 
 
 
153 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 
156 aa  153  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  54.3 
 
 
151 aa  153  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 
154 aa  153  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
154 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 
175 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
150 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
158 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  51.32 
 
 
163 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
149 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  48.39 
 
 
174 aa  150  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  49.03 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  49.03 
 
 
156 aa  150  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  52.08 
 
 
149 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
184 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
155 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.1 
 
 
154 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  49.03 
 
 
156 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 
160 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 
148 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 
148 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
173 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
147 aa  148  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  53.57 
 
 
160 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  49.34 
 
 
172 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 
175 aa  147  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  50.34 
 
 
154 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
154 aa  147  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
152 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 
156 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
180 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 
151 aa  147  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  47.4 
 
 
154 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 
152 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
154 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  49.68 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  45.7 
 
 
175 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
154 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
154 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  50.69 
 
 
155 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
154 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
149 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
154 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>