More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3535 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3535  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  76.97 
 
 		 151 aa  231  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  66.45 
 
 		 152 aa  207  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  65.77 
 
 		 162 aa  207  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  65.97 
 
 		 157 aa  204  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  60.9 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  61.44 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  58.96 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 		 161 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  59.09 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  59.09 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  54.79 
 
 		 193 aa  193  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  58.14 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  60.13 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1135  transcriptional regulator NrdR  64.43 
 
 		 154 aa  190  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  60.93 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  61.18 
 
 		 160 aa  190  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 		 158 aa  190  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  63.89 
 
 		 160 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  61.9 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  60.13 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  58.33 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  55.75 
 
 		 185 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  55.17 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  60.26 
 
 		 155 aa  187  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2136  transcriptional regulator NrdR  59.18 
 
 		 155 aa  185  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826839  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1562  transcriptional regulator NrdR  58.82 
 
 		 154 aa  185  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000599658  normal  0.0421133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  56.89 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  58.44 
 
 		 158 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  61.43 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1536  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like protein  56.29 
 
 		 161 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000992096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3422  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 156 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195421  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1267  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102239  normal  0.204854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 155 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1178  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.082767  normal  0.171861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2257  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 155 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.382244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0394  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.379881  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  55.1 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  58.5 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0185  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  48.72 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 148 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 154 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  47.44 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  47.02 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  47.52 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 151 aa  134  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  47.52 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  46.81 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>