More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1623 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 150 aa  306  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  88.67 
 
 		 150 aa  275  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  80 
 
 		 150 aa  254  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  78.67 
 
 		 150 aa  254  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  78.67 
 
 		 150 aa  254  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  79.33 
 
 		 150 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  78 
 
 		 150 aa  247  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  62.84 
 
 		 157 aa  204  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  59.33 
 
 		 155 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  57.05 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  57.05 
 
 		 151 aa  176  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  55.03 
 
 		 153 aa  173  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 154 aa  173  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 156 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 150 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  56 
 
 		 163 aa  167  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 154 aa  167  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  56 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 		 153 aa  166  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  53.69 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 153 aa  164  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  55.1 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  54.36 
 
 		 154 aa  159  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 154 aa  159  9e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  54.42 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  53.47 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 184 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  50.67 
 
 		 176 aa  154  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 155 aa  154  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  51.01 
 
 		 172 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  52.86 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  47.33 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  51.02 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  54.29 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 174 aa  150  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 164 aa  149  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 180 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>