More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1623 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 
159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  78.06 
 
 
159 aa  249  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  66.67 
 
 
148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  61.74 
 
 
154 aa  184  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  55.33 
 
 
154 aa  180  6e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
156 aa  177  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  55.03 
 
 
163 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
153 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
156 aa  173  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 
156 aa  173  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  54.49 
 
 
176 aa  171  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  55.26 
 
 
153 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  55.33 
 
 
150 aa  166  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 
156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  48.73 
 
 
158 aa  164  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  51.33 
 
 
151 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 
154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  50.93 
 
 
158 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
153 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  51.97 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
150 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
150 aa  159  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 
148 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
150 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
149 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 
150 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 
150 aa  158  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 
150 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 
150 aa  157  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 
153 aa  156  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
147 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.1 
 
 
162 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 
151 aa  153  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 
148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  43.67 
 
 
174 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
149 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
150 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
151 aa  148  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
154 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
154 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  51.35 
 
 
170 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 
155 aa  148  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
163 aa  147  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 
154 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
157 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
157 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
154 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
155 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 
174 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 
155 aa  147  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 
154 aa  147  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 
156 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
154 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
154 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.31 
 
 
154 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
154 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  50.7 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  48.59 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 
147 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 
154 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  44.52 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
149 aa  144  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  46.98 
 
 
172 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
175 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 
157 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 
147 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 
149 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 
149 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>