More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4041 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  56.95 
 
 		 153 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  56.29 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  57.42 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  57.82 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  58.78 
 
 		 150 aa  176  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  56.76 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 150 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 150 aa  167  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  53.29 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  52.32 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 180 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  52.63 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  50.68 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  41.61 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  45.62 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  51.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  42.5 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  46.05 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  50.32 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  43.87 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  44.44 
 
 		 172 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  51.63 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  43.87 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  47.71 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  45.81 
 
 		 157 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  48.98 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  42.31 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  46.15 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>