More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0279 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  73.33 
 
 		 152 aa  234  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  74.32 
 
 		 152 aa  231  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  67.55 
 
 		 150 aa  207  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 151 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  52.83 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  52.17 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 151 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  53.95 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  53.95 
 
 		 155 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 150 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 153 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 153 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  158  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  43.67 
 
 		 158 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  45.18 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  44.38 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  44.31 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.71 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 153 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 148 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 150 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  48.39 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 148 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  49.33 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  43.67 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  53.74 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 153 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  44.31 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 156 aa  147  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  47.68 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  45.28 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 148 aa  145  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  53.73 
 
 		 178 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>