More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1586 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  86.23 
 
 		 167 aa  292  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  77.63 
 
 		 170 aa  251  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  78.91 
 
 		 161 aa  250  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  72.39 
 
 		 163 aa  247  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  71.34 
 
 		 163 aa  244  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  78.62 
 
 		 164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  76.35 
 
 		 160 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  74.66 
 
 		 153 aa  237  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  72.85 
 
 		 170 aa  233  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  73.83 
 
 		 151 aa  231  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  69.33 
 
 		 163 aa  230  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  72.48 
 
 		 154 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  72.48 
 
 		 154 aa  227  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  72.85 
 
 		 153 aa  227  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  68.83 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  72.97 
 
 		 186 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  72.92 
 
 		 154 aa  221  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  70.47 
 
 		 157 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  72.3 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  71.72 
 
 		 183 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  68.83 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  69.33 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  69.33 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  69.33 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  69.59 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  68.21 
 
 		 167 aa  217  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  65.58 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  68.03 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  69.39 
 
 		 153 aa  213  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  66.67 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  61.21 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  66.25 
 
 		 161 aa  210  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  68.24 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  63.64 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  67.35 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  47.24 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  43.79 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  46.99 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  41.56 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 150 aa  137  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  46.62 
 
 		 148 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  41.77 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 149 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  43.51 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 173 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 153 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  66.34 
 
 		 102 aa  133  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.51 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>