More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 160 aa  323  9e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  78.43 
 
 		 163 aa  255  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  75.47 
 
 		 163 aa  244  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  77.12 
 
 		 167 aa  242  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  72.39 
 
 		 163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  78.23 
 
 		 170 aa  241  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  76.35 
 
 		 165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  78.62 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  74.83 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  71.52 
 
 		 151 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  72.22 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  71.23 
 
 		 164 aa  222  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  72.11 
 
 		 170 aa  221  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  67.9 
 
 		 166 aa  220  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  70.75 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  68.52 
 
 		 186 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  69.66 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  69.66 
 
 		 154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  68.97 
 
 		 167 aa  213  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  70.34 
 
 		 161 aa  211  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  65.99 
 
 		 153 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  69.18 
 
 		 154 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  67.81 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  68.49 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  68.49 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  62.5 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  68.49 
 
 		 154 aa  208  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 154 aa  208  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  67.12 
 
 		 183 aa  207  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  66.45 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  69.18 
 
 		 154 aa  207  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  68.21 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  63.46 
 
 		 156 aa  203  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  67.35 
 
 		 178 aa  202  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  67.12 
 
 		 151 aa  202  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  58.9 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 151 aa  190  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  67 
 
 		 102 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  47.83 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  39.33 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  42.18 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  42.76 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 164 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  39.33 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  42.48 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  39.86 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  41.06 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  39.86 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  39.74 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  41.22 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 181 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  45.75 
 
 		 160 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  42.11 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  40.76 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>