More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0042 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  68.32 
 
 
173 aa  226  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  68.71 
 
 
150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
151 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 
150 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  47.77 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
158 aa  153  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 
154 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 
161 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 
153 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  45.81 
 
 
155 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 
153 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 
153 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  52.26 
 
 
183 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 
153 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  48.99 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 
153 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  46.45 
 
 
156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 
154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  51.37 
 
 
176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 
179 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 
179 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  50.93 
 
 
156 aa  144  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 
154 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 
154 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
150 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 
157 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
156 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 
154 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 
154 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 
154 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 
157 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
151 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  48.34 
 
 
178 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  51.7 
 
 
154 aa  140  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
154 aa  140  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
153 aa  140  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 
157 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 
157 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  51.33 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  52.08 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  43.87 
 
 
156 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  43.87 
 
 
156 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  49.04 
 
 
163 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  49.04 
 
 
163 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 
163 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46 
 
 
150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  48.7 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  44.08 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 
159 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 
158 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  51.02 
 
 
172 aa  137  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  48.08 
 
 
154 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1612  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 
158 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  47.1 
 
 
158 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  49.29 
 
 
148 aa  136  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  48.73 
 
 
163 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  45.77 
 
 
154 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  42.48 
 
 
154 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 
159 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
150 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
150 aa  135  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 
150 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  49.33 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  45.16 
 
 
185 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 
149 aa  134  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  47.02 
 
 
182 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 
150 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 
161 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  40.4 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 
160 aa  134  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 
163 aa  134  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  45.22 
 
 
174 aa  134  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>