More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03461 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  90.51 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  89.31 
 
 		 159 aa  295  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  89.87 
 
 		 159 aa  292  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  63.52 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  63.52 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  60.76 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  61.64 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  55.06 
 
 		 158 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  57.86 
 
 		 164 aa  193  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 		 179 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  58.11 
 
 		 179 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  58.78 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  53.59 
 
 		 175 aa  176  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  51.63 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0695  transcriptional regulator NrdR  56.96 
 
 		 168 aa  164  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331414  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.16 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  45.45 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  147  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  45.57 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.16 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  43.24 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 156 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  42.48 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  42.76 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  44.16 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  45.95 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.37 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  42.28 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  43.24 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  38.82 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  43.42 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  41.18 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  37.5 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  37.5 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  40.65 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2339  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  41.83 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  39.1 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  43.57 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  43.14 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  38.61 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.57 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>