More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0695 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0695  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 168 aa  334  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331414  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  64.81 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  64.81 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  68.24 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  68.92 
 
 		 184 aa  213  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  62.42 
 
 		 175 aa  211  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 157 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  64.83 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  63.51 
 
 		 158 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  57.59 
 
 		 159 aa  200  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  57.59 
 
 		 159 aa  200  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  56.33 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 159 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  56.96 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  52.38 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 151 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  47.56 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.91 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 		 148 aa  154  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 153 aa  154  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  51.35 
 
 		 150 aa  154  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  46.62 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.81 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 153 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.13 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  48.08 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  48.61 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  45.83 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  43.06 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  42.28 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  43.92 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  46.3 
 
 		 158 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.26 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  43.21 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>