More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0048 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  51.7 
 
 		 151 aa  157  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  54.61 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50.96 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  49.65 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  51.28 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  49.32 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  49.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.35 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  49.08 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  49.08 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  48.63 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  48.77 
 
 		 172 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  48.05 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  50.64 
 
 		 159 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  50.32 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  46.15 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  50.32 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  48.68 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  46.5 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  47.71 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  48.39 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 175 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  44.08 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0324  transcriptional regulator NrdR  49.36 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>