More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1690 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 159 aa  326  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 159 aa  326  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  74.21 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  67.09 
 
 		 158 aa  226  7e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  67.09 
 
 		 158 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  63.52 
 
 		 159 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  63.29 
 
 		 159 aa  213  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  62.89 
 
 		 159 aa  212  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  63.92 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0469  transcriptional regulator NrdR  67.92 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  61.07 
 
 		 184 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  59.46 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  59.46 
 
 		 179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  59.46 
 
 		 179 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  60.26 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  54.42 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0695  transcriptional regulator NrdR  57.59 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331414  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  54.19 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  51.95 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  151  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 153 aa  150  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  46.84 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.59 
 
 		 148 aa  143  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  46 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  41.72 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  42.86 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 165 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  42.57 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  41.89 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  43.24 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.3 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  43.24 
 
 		 183 aa  133  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  42.21 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2946  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  43.54 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  45.95 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  41.22 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  40.91 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  39.86 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  44.29 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>