More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0838 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  46.94 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  45.75 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.58 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  42.68 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.59 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 153 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  41.61 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  42.58 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  38.51 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  42.36 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  45.07 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  41.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  42.76 
 
 		 175 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  40 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  42.14 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  38.99 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  39.33 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>