More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1249 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 156 aa  323  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  93.55 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  93.55 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  54.25 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  57.04 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  57.43 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  56.76 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  56.46 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  53.59 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 153 aa  167  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  48.34 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  52.17 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.67 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  52.7 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  48.08 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  51.03 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  156  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 155 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 163 aa  153  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  43.54 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  49.03 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  48.68 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0266  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  46.45 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  45.14 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 179 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 179 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 175 aa  140  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  47.86 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  46.31 
 
 		 176 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  42.38 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  42.76 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  45.52 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  44.9 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  41.67 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.43 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  46.43 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>